Caracterizado por una topografía bastante plana y una longitud de aproximadamente 300 metros de norte a sur y 360 metros de este a oeste, Na Moltona presenta un paisaje costero rocoso con una pequeña playa en el lado noreste. La isla se distingue por los restos de la época talayótica, testigos del paso de antiguas civilizaciones. La vegetación predominante en la parte este está compuesta por adelfas, lentiscos, aladiernos y enebros, mientras que la parte oeste es más seca y está caracterizada únicamente por la presencia de lygeum. En cuanto a la fauna, a pesar de las modestas dimensiones del islote, es posible encontrar una población considerable de conejos y la presencia de una especie particular de lagartija de las Baleares, la Podarcis lilfordi jordansi, exclusiva de Na Moltona y del islote de Na Guardis. Además, las aguas al sur de la isla son zona de nidificación para numerosos ejemplares de gaviotas, ofreciendo una auténtica muestra de la biodiversidad mediterránea.